Está considerado estilísticamente como del gótico final (S. XV) con elementos mudéjares en algunas de sus capillas.

La fachada principal de estilo clásico realizada en 1613 da acceso a la nave gótica de la iglesia que se remonta a finales del siglo XV.

La portada de la epístola es mudéjar y está formada por un arco apuntado de gran abertura, aunque muy mutilado por haberlo almohadillado con posterioridad, y termina en un alero decorado con diferentes canes. El tramo de tránsito al interior se cubre con una interesante bóveda con decoración de lacería.

El retablo mayor, construido en el siglo XVII con profundas modificaciones en el XVIII, es barroco y está compuesto por trece tablas principales/ presidido por la imagen del titular, obra del pintor Rodríguez de Losada.

La hermandad de la Santa Cena tiene su sede en la iglesia de San Marcos y el grupo escultórico que la representa es obra de Luis Ortega Bru.